Изборът на новите комисари ще бъде сложен процес, в който фон дер Лайен трябва да се опита да постигне съгласие относно разпределението на комисариатите. Това съгласие трябва да обхваща не само самите личности, но и разпределянето на конкретни портфейли и балансираното представителство на различните политически партии.
Въпреки че фон дер Лайен носи крайната отговорност, премиерите на държавите членки на ЕС имат голям неформален влияние върху разпределението на портфейлите предварително. В крайна сметка Европейският парламент трябва да одобри предложените комисари и разпределението на задачите.
Едно от най-големите предизвикателства за фон дер Лайен е стремежът ѝ към комисия с балансирано участие на половете. През 2019 г. тя успя да постигне за първи път равнопоставено разпределение между мъже и жени в Комисията, но сега това изглежда много по-трудно. Въпреки че призова държавите членки да номинират както мъжки, така и женски кандидат, повечето от тях са предложили само един мъжки кандидат. Това заплашва да наруши баланса между половете.

