Η επιλογή των νέων Επιτρόπων θα είναι μια περίπλοκη διαδικασία, όπου η Φον ντερ Λάιεν πρέπει να προσπαθήσει να βρει συμφωνία σχετικά με την κατανομή των επιτροπών. Αυτή η συμφωνία δεν αφορά μόνο τα ίδια τα πρόσωπα, αλλά και την ανάθεση συγκεκριμένων χαρτοφυλακίων και την ισορροπημένη εκπροσώπηση διαφόρων πολιτικών κομμάτων.
Αν και η Φον ντερ Λάιεν φέρει την τελική ευθύνη, οι πρωθυπουργοί των κρατών-μελών της ΕΕ έχουν μεγάλη ανεπίσημη επιρροή στην κατανομή των χαρτοφυλακίων εκ των προτέρων. Τελικά, το Ευρωπαϊκό Κοινοβούλιο πρέπει να συμφωνήσει με τους προτεινόμενους Επιτρόπους και την κατανομή των καθηκόντων.
Ένα από τα μεγαλύτερα εμπόδια για τη Φον ντερ Λάιεν είναι η επιδίωξή της για μια ισορροπημένη κατά φύλο Επιτροπή. Το 2019 πέτυχε να δημιουργήσει για πρώτη φορά μια ισορροπημένη αναλογία ανδρών και γυναικών στην Επιτροπή, αλλά τώρα φαίνεται σημαντικά δυσκολότερο. Παρόλο που είχε ζητήσει από τα κράτη-μέλη να προτείνουν τόσο έναν άνδρα όσο και μια γυναίκα υποψήφιο, τα περισσότερα κράτη υπέβαλαν μόνο έναν άνδρα υποψήφιο. Αυτό απειλεί να διαταράξει την ισορροπία των φύλων.
Τα κράτη που προτείνουν για εκ νέου διορισμό τον υφιστάμενο Επίτροπό τους δεν χρειάστηκε να υποβάλουν δεύτερο υποψήφιο, γεγονός που περιορίζει ακόμη περισσότερο τον αριθμό των προτεινόμενων γυναικών. Επιπλέον, ορισμένα κράτη έχουν εκφράσει έντονες προτιμήσεις για συγκεκριμένα χαρτοφυλάκια, ιδιαίτερα στον οικονομικό-χρηματοοικονομικό τομέα, γεγονός που περιπλέκει ακόμα περισσότερο τις διαπραγματεύσεις.
Ένα άλλο χαρτοφυλάκιο που συγκεντρώνει μεγάλη προσοχή είναι αυτό της Γεωργίας. Παραδοσιακά αυτό το χαρτοφυλάκιο πηγαίνει σε ένα μικρότερο κράτος-μέλος της ΕΕ και συχνά θεωρείται από τις λιγότερο ελκυστικές θέσεις, ωστόσο παίζει κρίσιμο ρόλο στην κατανομή επιδοτήσεων και τη ρύθμιση εντός της ΕΕ.
Φέτος, ο υπουργός του Λουξεμβούργου Κριστόφ Χάνσεν, μέλος του κεντροδεξιού Ευρωπαϊκού Λαϊκού Κόμματος (ΕΛΚ), φαίνεται να είναι ο βασικός υποψήφιος για αυτή τη θέση. Ο Χάνσεν είναι από τους λίγους που έχει εκφράσει ανοιχτά το ενδιαφέρον του για αυτή τη θέση, γεγονός που τον καθιστά πιθανολογούμενη επιλογή.