Αυτές οι επιδοτήσεις, που ανέρχονται ετησίως σε εκατοντάδες εκατομμύρια ευρώ, έχουν σκοπό να στηρίξουν ομάδες υπεράσπισης συμφερόντων και οργανώσεις στην ενημέρωση και συμβουλευτική για νέα σχέδια πολιτικής της ΕΕ. Τέτοιες οργανώσεις δραστηριοποιούνται όχι μόνο στον τομέα της φύσης και του περιβάλλοντος, αλλά επίσης σε θέματα υγείας, δημόσιας συγκοινωνίας, ανθρωπίνων δικαιωμάτων και κοινωνικών ζητημάτων.
Αυτές οι ομάδες συχνά ασκούν κριτική στα σχέδια της ΕΕ, αλλά λόγω της εξειδίκευσής τους – με υποστήριξη της ΕΕ – καλούνται σε ευρωπαϊκές συνεδριάσεις. Φιλικοί προς τους αγρότες ευρωπαίοι πολιτικοί υποστηρίζουν ότι η κριτική των περιβαλλοντικών οργανώσεων για την αγροτική πολιτική είναι αδικαιολόγητη και επιζήμια για τον αγροτικό τομέα.
Οι ευρωβουλευτές είναι διχασμένοι στο ζήτημα. Κάποιοι θεωρούν τις επιδοτήσεις απαραίτητες για την προώθηση της δημοκρατικής συμμετοχής και την εκπροσώπηση ενός ευρέος φάσματος απόψεων. Άλλοι υποστηρίζουν αυστηρότερους κανόνες ώστε να αποτραπεί η χρήση των επιδοτήσεων της ΕΕ για μονομερείς εκστρατείες.
Στο Ευρωπαϊκό Κοινοβούλιο, κυρίως οι γερμανοί Χριστιανοδημοκράτες του ΕΛΚ διαμαρτύρονται εναντίον αυτής της πρακτικής εδώ και μερικά χρόνια. Κατά την άποψή τους, ορισμένες περιβαλλοντικές οργανώσεις χρησιμοποιούν πόρους της ΕΕ για εκστρατείες που παρουσιάζουν τους αγρότες με αρνητικό τρόπο. Η Μονίκα Χόλμαιερ από το Βαυαρικό ΕΛΚ (μέλος της Επιτροπής Ελέγχου Προϋπολογισμού) καταδίκασε το γεγονός ότι οι Βρυξέλλες επιδοτούν «αντι-γεωργικές δράσεις».
Απάντηση σε αυτό έδωσαν άλλοι ευρωπαίοι πολιτικοί επισημαίνοντας ότι η κυρία Χόλμαιερ έχει ετήσιες απολαβές 75.000 ευρώ ως πρόσθετο εισόδημα στο μισθολόγιο της γερμανικής αγροτικής εταιρείας Baywa, και συνεπώς αποτελεί μέρος του γεωργικού λόμπι στην ΕΕ. Παλαιότερα η Χόλμαιερ και άλλοι είχαν αντιδράσει έντονα όταν οι Βρυξέλλες ήθελαν να περικόψουν μερικά εκατομμύρια ευρώ από τον προϋπολογισμό εκατοντάδων εκατομμυρίων για διαφήμιση της κατανάλωσης κρέατος.
Αυτή τη φορά, η νέα ολλανδική κοινοβουλευτική ομάδα BBB στο Ευρωπαϊκό Κοινοβούλιο συντάχθηκε επίσης με την εκστρατεία κατά του πρώην Επιτρόπου Φρανς Τίμερμανς που προωθεί η εφημερίδα De Telegraaf, και με την κριτική του γεωργικού λόμπι προς τις διαμαρτυρίες των περιβαλλοντικών οργανώσεων. Σε αυτό το πλαίσιο, η κριτική για τη δομή των επιδοτήσεων σε πολλούς τομείς περιορίζεται στην κατηγορία ότι ο Τίμερμανς δήθεν έδινε κρυφά εκατομμύρια της ΕΕ σε περιβαλλοντικές οργανώσεις για να ενοχλούν τους αγρότες.
Οι περιβαλλοντικές οργανώσεις υπερασπίζονται το έργο τους τονίζοντας ότι η κριτική τους βασίζεται σε επιστημονική έρευνα. Υποστηρίζουν ότι πολλές μορφές εντατικής γεωργίας βλάπτουν τη βιοποικιλότητα και συμβάλλουν στην κλιματική αλλαγή. Αυτές οι οργανώσεις τονίζουν πως το έργο τους είναι απαραίτητο για να διεξαχθεί μία ισορροπημένη συζήτηση για βιώσιμη πολιτική.