La selección de los nuevos Comisarios será un proceso complicado, en el que Von der Leyen deberá intentar llegar a un acuerdo sobre la distribución de los comisariados. Este acuerdo no solo debe referirse a las personas mismas, sino también a la asignación de carteras específicas y a la representación equilibrada de los diferentes partidos políticos.
Aunque Von der Leyen tiene la responsabilidad final, los jefes de gobierno de los países de la UE tienen una gran influencia informal previa en la distribución de las carteras. Finalmente, el Parlamento Europeo debe aprobar a los Comisarios propuestos y la distribución de tareas.
Uno de los mayores obstáculos para Von der Leyen es su objetivo de lograr una Comisión con equilibrio de género. En 2019 logró, por primera vez, una distribución equilibrada entre hombres y mujeres en la Comisión, pero ahora parece mucho más difícil. Aunque había solicitado a los Estados miembros que propusieran tanto un candidato masculino como uno femenino, la mayoría de los países solo presentaron un candidato masculino. Esto amenaza con desequilibrar la paridad de género.