Euroopan komissio pitää kiinni siitä, että karjatalouden, siipikarjan ja sikatalouden ilman- ja maaperän saastuttamista on hillittävä. Komission tiedottaja totesi, että maatalouslautakunnan vastalauseet teollisten päästöjen direktiivin (RIE) laajentamista vastaan ovat liioiteltuja.
Bryssel haluaa jatkossa sisällyttää karjatalouden alle, kun karjaa on vähintään 150 yksikköä, sekä tiukentaa sikaloiden ja siipikarjatilojen kriteerejä, jotta enemmän tiloja tulisi direktiivin piiriin. Euroopan komissio on kuitenkin valmis tekemään osittaisia kompromisseja. Komissio kiistää, että kyse olisi määräysvaltaisesta sääntelystä: kaikilla on ollut mahdollisuus osallistua keskusteluun.
Euroopan parlamentin ympäristövaliokunta (ENVI) on samaa mieltä siitä, että myös näissä sektoreissa 'saastuttaja maksaa'. Maatalousvaliokunta (AGRI) vastustaa nykyisiä ehdotuksia (kuten monet EU-maat), mutta Vihreät kertovat pyrkivänsä tulevissa trialogineuvotteluissa kompromissitekstien laatimiseen.
Yhdistetyssä kuulemistilaisuudessa Euroopan komission tiedottaja korosti, että karjatalouden osalta kyse on vain hyvin suurista karjatiloista; noin viisitoista prosenttia koko tilakannasta. Useat europarlamentaarikot, kuten hollantilainen CDA:n Annie Schreijer-Pierik, huomauttivat, että joissakin karjatalousvaltaisissa maissa 150 eläinyksikköä ei ole lainkaan suuri määrä.
Lähes kaikki maatalousvaliokunnan jäsenet kompastuivat lisäksi teollisuuden käsitteeseen RIE-direktiivin nimessä, ikään kuin nuo kolme elinkeinoa olisivat suurteollisuutta. Komission tiedottaja totesi, että RIE-direktiivin nimi on ollut käytössä vuosia, ja nyt sitä sovelletaan hieman laajemmin karjatalouden osalta. Lisäksi komissio heitti pallon pitkälti takaisin europarlamentaarikoille muistuttamalla, että tekemättä jättäminen ei ole ratkaisu.
Moni kuultu argumentti tiukempia ympäristövaatimuksia vastaan maataloudessa on, että maataloussektori on jo monilla alueilla vähentänyt saastumista merkittävästi. Euroopan kansanpuolueen (EVP) kristillisdemokraatit katsovat siksi, että uusilta ympäristövaatimuksilta tulisi toistaiseksi pidättäytyä. Komissio kuitenkin korostaa, että nitraattisaastumista ei ole vähennetty vuosikymmeniin.
RIE:n pääasiallinen tavoite, jonka mukaan yritysten olisi muutaman vuoden kuluttua käytettävä käytettävissä olevia parhaita teknologioita, kohtaa paljon kritiikkiä. Se merkitsee aivan eri asioita pienelle sikatilalle Kyproksella kuin suurelle sikatilalle Saksassa tai Espanjassa, todettiin.
Hollantilainen SGP:n Bert-Jan Ruissen esitti kollegoilleen, että maatalouspolitiikka saattaa tarvita täysin uutta lähestymistapaa: EU ei määrää keinoja tai teknologiaa, vaan asettaa tavoitteet. Tämän jälkeen viljelijä saa lain puitteissa itse valita keinot tavoitteen saavuttamiseksi. "Tämä tarkoittaa kuitenkin, että eläinten hyvinvointi, ympäristö ja ilmasto on otettava mukaan näiden tavoitteiden laskelmiin", hän varoitti.