इससे पर्यावरण मंत्री यूरोपीय आयोग के प्रस्ताव और उस यूरोपीय संसद के प्रस्ताव से काफी भिन्न होते हैं जो कि अधिक सख्त चाहता है।
मंत्रियों का मानना है कि सीवेज ट्रीटमेंट प्लांट बनाने की अनिवार्यता छोटे गांवों और उन क्षेत्रों के लिए नहीं होनी चाहिए जहां 1250 से कम निवासी हों। पर्यावरण आयुक्त विरिगिनियस सिस्केविचियस चाहते हैं कि अधिक क्षेत्रों में शुद्धिकरण अनिवार्य हो।
इसके विपरीत, मंत्रियों का कहना है कि केवल स्वच्छ जल के प्राकृतिक और पर्यावरणीय महत्व को ही नहीं देखना चाहिए, बल्कि जनस्वास्थ्य को भी ध्यान में रखना चाहिए। इसलिए अब यह अनिवार्यता भी शामिल की गई है कि EU देशों को अपशिष्ट जल में रोगजनकों, संक्रामक बैक्टीरिया और खतरनाक रासायनिक पदार्थों की उपस्थिति के लिए जांच करनी होगी। इससे अन्य आयुक्तों को भी इस विषय पर बोलने का अधिकार मिलेगा।
इसके अलावा, मंत्री चाहते हैं कि हाल ही में EU में शामिल हुए देशों को 8 से 12 साल का अतिरिक्त समय दिया जाए क्योंकि उन्होंने पिछले वर्षों में EU निर्देशों को लागू करने के लिए पर्याप्त निवेश किया है।
बीस वर्षों के भीतर सदस्य देशों को यह सुनिश्चित करना होगा कि 150,000 निवासियों वाले बड़े संयंत्रों पर तृतीयक शुद्धिकरण (नाइट्रोजन और फॉस्फोरस का निष्कासन) लागू किया जाए। जब शुद्ध अपशिष्ट जल कृषि सिंचाई के लिए पुन: उपयोग किया जाता है, तब पर्यावरण या स्वास्थ्य के लिए कोई जोखिम न हो, तो छूट दी जा सकती है।
पर्यावरण आयुक्त सिस्केविचियस कहते हैं, "जल एक कीमती संसाधन है जो लगातार दुर्लभ होता जा रहा है। शहरी अपशिष्ट जल को उपलब्ध तकनीक के साथ सफलतापूर्वक शुद्ध किया जा सकता है।" उनके अनुसार, यह किसानों के लिए बहुत सारे अवसर खोलता है क्योंकि वे पुनर्प्राप्त जल को सिंचाई के लिए सुरक्षित रूप से उपयोग कर सकते हैं।
EU कहता है कि प्रति वर्ष 40,000 मिलियन क्यूबिक मीटर से अधिक अपशिष्ट जल का शोधन किया जाता है, लेकिन केवल 2.4% जल को इस तरह की अतिरिक्त प्रक्रिया दी जाती है कि वह कृषि में उपयोग के योग्य हो। यह ब्रुसेल्स द्वारा मानदंड कड़े करने के कारणों में से एक है।

