नए आयोग के सदस्यों का चयन एक जटिल प्रक्रिया होगी, जिसमें वॉन देर लेयेन को आयोग की जिम्मेदारियों के आवंटन को लेकर सहमति बनानी होगी। यह सहमति केवल व्यक्तियों पर नहीं, बल्कि विशेष पोर्टफोलियो के आवंटन और विभिन्न राजनीतिक पार्टियों के संतुलित प्रतिनिधित्व पर भी होनी चाहिए।
हालांकि अंतिम जिम्मेदारी वॉन देर लेयेन की है, यूरोपीय संघ के देशों के प्रधानमंत्रियों का पोर्टफोलियो के आवंटन पर पहले से ही एक बड़ा अनौपचारिक प्रभाव होता है। अंत में, प्रस्तावित आयोग सदस्यों और कार्य विभाजन को यूरोपीय संसद की मंजूरी मिलनी जरूरी है।
वॉन देर लेयेन के लिए सबसे बड़ी बाधाओं में से एक संतुलित लिंग प्रतिनिधित्व वाली आयोग की स्थापना है। 2019 में उन्होंने पहली बार आयोग में पुरुष और महिला सदस्यों का संतुलन स्थापित किया था, लेकिन अब यह कार्य कहीं अधिक कठिन प्रतीत हो रहा है। उन्होंने सदस्य देशों से पुरुष और महिला दोनों उम्मीदवारों को नामित करने का अनुरोध किया था, फिर भी अधिकांश देशों ने केवल पुरुष उम्मीदवार ही प्रस्तुत किए हैं। इससे लिंग संतुलन बिगड़ने का खतरा है।

