U više od polovice slučajeva površinske vode sadrže previše pesticida. Time nizozemske površinske vode spadaju među najonečišćenije vode u Europi. To proizlazi iz istraživanja velike nizozemske ekološke organizacije o tome kako trinaest regionalnih županijskih uprava izvršava svoje zadatke.
Istraživanje pokazuje da neke županije još uvijek nisu uvele EU-regule protiv onečišćenja vode koje su na snazi već dugi niz godina. Ekološka organizacija zagovara da državna vlada u Haagu preuzme zadatak rješavanja ovog problema. Također je predloženo dopuštanje samo ekološkog poljoprivrednog uzgoja u osjetljivim područjima.
Europa obavezuje zemlje da prestanu ili smanje upotrebu pesticida u područjima zaštite podzemnih voda i u zaštićenim područjima Natura 2000. Županije su trenutno glavne odgovorne za zaštitu tih područja, ali i dalje dopuštaju korištenje mnogih, često vrlo otrovnih, pesticida.
U tim područjima nalaze se mnoge biljke koje često zahtijevaju intenzivnu primjenu pesticida, poput krumpira, lukovica cvijeća i krušaka. Budući da Nizozemska na taj način krši europsko pravo, ekološka organizacija podnijela je pritužbu Europskoj uniji na nizozemsku politiku.
Čak i izvan tih osjetljivih područja Nizozemska premalo čini za zaštitu vode. Zaštitne zone trebale bi spriječiti da pesticidi prilikom prskanja dospiju u obližnje kanale. Nizozemska uglavnom ima zaštitne pojaseve široke tek oko metar, no za smanjenje ispiranja za otprilike tri četvrtine, ti bi pojasevi trebali biti široki najmanje 15 do 20 metara.
U nizinskom i vodenom poljoprivrednom krajoliku Nizozemske kanali su često smješteni samo nekoliko desetaka metara jedan od drugog. Uvođenje zabrane gnojidbe u tako širokim europskim pojasima uz kanale značilo bi da bi gotovo nigdje to nije bilo dopušteno.