Europska komisija inzistira da se nešto mora učiniti protiv zagađenja zraka i tla koje uzrokuju stočarstvo, peradarstvo i industrija svinja. Glasnogovornik Komisije izjavio je da se prigovori Odbora za poljoprivredu na proširenje Direktive o industrijskim emisijama (DIE) previše naglašavaju.
Bruxelles želi da se stočarstvo s minimalno 150 grla ubuduće također uključi, kao i da se za svinjogojstvo i peradarstvo pooštre kriteriji kako bi više poduzeća bilo obuhvaćeno. Europska komisija je ipak spremna na kompromis u određenim dijelovima. Komisija demantira tvrdnje da je riječ o nametnutim pravilima: svi su mogli sudjelovati u raspravi.
Odbor ENVI za okoliš Europskog parlamenta slaže se da i u tim sektorima 'zagađivač plaća'. AGRI-odbora za poljoprivredu protivi se trenutačnim prijedlozima (kao i mnoge vlade EU), no Zeleni poručuju da će u nadolazećem trilogu doći s kompromisnim tekstovima.
Tijekom zajedničkog saslušanja glasnogovornik Europske komisije naglasio je da se kod stočarstva radi samo o veoma velikim farmama; najviše oko petnaest posto. No, neki europarlamentarci, poput nizozemske zastupnice CDA Annie Schreijer-Pierik, ukazali su da u zemljama s puno stočarstva 150 grla i nije tako velika farma.
Gotovo svi članovi AGRI-odbora također su imali primjedbe na pojam 'industrijski' u nazivu Direktive, kao da su ta tri sektora velike industrije. Glasnogovornik Komisije mogao je samo istaknuti da taj naziv Direktive o industrijskim emisijama postoji već dugi niz godina te da se sada odnosi na nešto veći dio stočarstva. Komisija je pak dijelom odgovornost prebacila na europarlamentarce podsjetivši ih da nečinjenje nije rješenje.
Čest argument protiv strožih okolišnih zahtjeva u poljoprivredi jest da je taj sektor već mnogo smanjio zagađenje na brojnim područjima. Zastupnici EVP kršćanskih demokrata stoga čak smatraju da bi za sada trebala vrijediti zabrana novih okolišnih zahtjeva. Komisija međutim ističe da se zagađenje nitrate već desetljećima ne smanjuje.
Glavni cilj Direktive o industrijskim emisijama (koja će za nekoliko godina obvezati sektor na korištenje najsuvremenijih dostupnih tehnologija) izaziva također mnogo kritika. Primijećeno je da će to za malog uzgajivača svinja na Cipru biti posve drugačije nego za velike farme svinja u Njemačkoj ili Španjolskoj.
Nizozemski zastupnik SGP Bert-Jan Ruissen predložio je kolegama da bi se politika zaštite okoliša u poljoprivredi možda trebala posve drugačije uređivati: da Europska unija više ne propisuje sredstvo ili tehniku već cilj. A da onda poljoprivrednik – unutar zakona – sam pronalazi načine da postigne taj cilj. 'To znači da u izračune tih ciljeva moramo uključiti dobrobit životinja, okoliš i klimu', upozorio je.