Brüsszel kérésére az uniós országok gyakran egy-két évig késlekednek az „irreguláris kiadások” visszafizettetésével.
Az uniós források „visszakövetelése” azt jelenti, hogy kérik a részleges vagy teljes visszafizetést azon szervezetek vagy kedvezményezettek által kapott összegekből, amelyekről utólag megállapították, hogy nem tartották be a finanszírozási feltételeket. A visszaszerzés gyakran nagyon sokáig tart, ha egyáltalán megtörténik, és a források 1–8 %-át végül elengedik.
A Számvevőszék 2022-es éves jelentése szerint a hibás kiadások aránya 2021 óta nőtt, 3 %-ról 4,2 %-ra emelkedve az uniós költségvetésből. Ezáltal a tényleges visszakövetelés egyre sürgetőbb problémává válik.
Mivel a költségvetés alig negyedét kezeli közvetlenül az Európai Bizottság, a maradék háromnegyedét viszont az uniós országokkal vagy más szervezetekkel közösen, néha nehéz elkerülni a hibákat és behajtani a pénzt.
Közvetlen és közvetett kezelés esetén az Európai Bizottság felelős az irreguláris kiadások megállapításáért és a túlzott kifizetések visszaköveteléséért. Megosztott kezelés alatt Brüsszel átadja ezeket a feladatokat az uniós országoknak, de az utolsó felelősség őt terheli.
A számvevők azt javasolják, hogy bizonyos ösztönző intézkedéseket az előző pénzügyi időszakból vezessenek vissza, hogy az uniós országok mezőgazdasági ágazatban is behajthassák a pénzeket. Az elmúlt időszakban a tagállamoknak vissza kellett fizetniük az EU-költségvetésnek annak a felét, amelyet négy-nyolc éven belül nem hajtottak be.