ブリュッセルから「不正支出」の返還要請があっても、EU加盟国が対応を始めるまでに通常1～2年かかる。
EU資金の「回収」とは、支払先の組織や受益者が後に資金の要件を満たしていなかったと判明した場合に、その（部分的な）返還を求めることを指す。返還が行われたとしても回収まで著しく時間がかかり、最終的に1～8％の資金が放棄されることがある。
会計検査院の2022年年次報告によると、誤出費率は2021年以降、EU予算に占める割合が3％から4.2％に上昇している。これにより、実際の資金回収はますます喫緊の課題となっている。
欧州委員会が直接管理する予算はまだ4分の1に満たず、残りの4分の3はEU加盟国や他の機関と共同で管理しているため、過誤の防止や資金回収が時に困難である。
直接管理および間接管理の場合、欧州委員会は不正支出の判定と過剰支払いの回収に責任を持つ。共有管理の場合、ブリュッセルはこれらの業務をEU加盟国に委任するが、最終責任は負う。
監査官は現在、前回の財政期間における特定の刺激策を再導入し、EU加盟国が農業部門で資金を回収できるよう提案している。過去の期間では、加盟国が4～8年以内に回収できなかった資金の半分をEU予算に返還しなければならなかった。