土壌サンプルの結果は公開登録簿に保存され、その後、近隣住民や市民が汚染を引き起こした者に対し損害賠償請求を行うことが可能となる。土壌登録システムときれいな土壌証明の仕組みは、土地所有者や農家、園芸業者への補助金と組み合わせることもできる。
EUには300万以上の既知の汚染地点が存在し、近年ではEU加盟国すべてで集中的な土壌調査が実施されたわけではない。オランダには、およそ25万箇所の重大な汚染の可能性がある場所がある。例えば（旧）化学洗浄工場、ガソリンスタンド、ガレージ、ガス工場、あるいはかつて禁止薬剤が使われていた農地などだ。
提案されている指令案は農業分野から異議が出ている。農業大臣らとオランダの農業団体LTOは深刻な懸念を表明している。LTOオランダによれば、追加の制限や義務は望ましくなく、欧州連合はそれぞれの加盟国の特有の状況やニーズを考慮すべきだとしている。
また、現ユニリーバの環境活動家で元CEOのポール・ポールマンも「重要な法案」であると述べる一方、健康な土壌の定義が不十分であると指摘した。彼は「より厳格な目標設定」が策定されること、さらにそれが「非常に場所と作物に特化したもの」であることを望んでいる。
欧州のクリーンソイル規制は強制力のある指令にはならず、2050年やその間の年に対する成果義務も設けられていない。環境保護団体は欧州委員会に対し、土壌侵食防止のために拘束力のある目標設定を求めている。しかし環境担当委員のヴィルギニウス・シンケヴィチウスは、まずは土壌の状態のさらなる悪化を防ぐことに注力し、その後に浄化と改善を行う方針だと述べた。
次の意思決定プロセスの段階では、欧州議会のenvi環境委員会がこの指令案に対する見解を決定する必要がある。この段階を経て初めて、環境大臣らと欧州委員会間の三者協議が始まり、さらなる妥協や決定が見込まれている。