De weerstand komt vooral van milieuorganisaties en kritische burgers die vrezen dat de CSU-politicus agrarisch beleid gaat voeren dat schadelijk is voor klimaat en biodiversiteit.
Felßner bekleedt momenteel de functie van voorzitter van de Beierse Boerenbond en is tevens vicevoorzitter van de federale Duitse Boerenbond. Zijn nauwe banden met de agrarische sector en zijn uitgesproken standpunten maken hem voor sommigen tot een controversiële kandidaat voor de ministerspost. Hij geniet de steun van de conservatieve Beierse minister-president Markus Söder (CSU), die zijn invloed aanwendt om Felßner in het kabinet van CDU-leider Friedrich Merz te krijgen.
Milieuorganisaties zeggen dat Felßner wetenschappelijke inzichten negeert over de negatieve effecten van pesticiden en de klimaatimgevolgen van vleesconsumptie. Tijdens een CSU-partijcongres begin februari stelde hij wetenschappelijke feiten over soorten- en klimaatbescherming ter discussie en noemde hij de vermindering van de veestapel een doodlopende weg.
In 2023 riep Felßner tijdens een boerendemonstratie op om 'vlees voor het klimaat' te eten. Ook dreigde hij als een van de leiders van de boerenprotesten het land plat te leggen. In 2018 is hij veroordeeld voor bodem- en waterverontreiniging omdat hij gedurende langere tijd vocht en vloeistoffen van zijn erf naar een aangrenzend natuurgebied liet lekken. Dergelijke uitspraken en incidenten hebben zijn reputatie als landbouwbestuurder beschadigd.
Toch blijft Felßner populair binnen boerenorganisaties, die zijn benoeming als een kans zien om het Duitse agrarisch beleid sterker te laten aansluiten bij de belangen van de landbouwsector. Veel boeren zien hem als een verdediger van traditionele landbouwmethoden en een tegenstander van strikte milieuregels, die zij als bedreigend voor hun bedrijfsvoering beschouwen.
Naast de petitie van het Umweltinstitut München hebben diverse burgerinitiatieven en groene politieke partijen hun zorgen geuit over de mogelijke benoeming. Demonstraties en protestacties worden voorbereid om druk uit te oefenen op CDU-leider Friedrich Merz, die uiteindelijk zal beslissen wie de ministerpost krijgt. De weerstand tegen Felßner maakt deel uit van een bredere politieke strijd over de toekomst van de Duitse landbouw.
Friedrich Merz heeft zich nog niet expliciet uitgesproken over de kwestie. Binnen de CDU bestaat verdeeldheid over de vraag of een uitgesproken landbouwlobbyist als Felßner geschikt is voor de ministerspost. Sommige partijleden vrezen dat zijn benoeming het imago van de partij als modern en klimaatbewust kan schaden, terwijl anderen hem juist zien als een krachtige vertegenwoordiger van de agrarische achterban.