Europeiska kommissionen insisterar på att något måste göras åt luft- och markföroreningar från djurhållning, fjäderfä- och svinindustrin. En talesperson för kommissionen sade att invändningarna från jordbruksutskottet mot en utvidgning av Industrilogdirektivet (IED) överdrivs kraftigt.
Brüssel vill att djurhållning med minst 150 djur framöver också ska omfattas och skärpa kriterierna för svinuppfödning och fjäderfä så att fler företag omfattas. Kommissionen är villig att göra kompromisser i vissa delar. Kommissionen förnekar att det rör sig om en påtvingad regel: alla har fått vara med och diskutera.
Miljöutskottet (ENVI) i Europaparlamentet håller med om att förorenaren ska betala även inom dessa sektorer. Jordbruksutskottet (AGRI) motsätter sig de nuvarande förslagen (liksom många EU-regeringar), men De Gröna meddelar att de under den kommande trilogförhandlingen kommer med kompromisstexter.
Vid en gemensam utfrågning betonade en talesperson för Europeiska kommissionen att det bara handlar om mycket stora djurhållningar; högst cirka femton procent. Flera ledamöter av Europaparlamentet, såsom nederländska CDA-medlemmen Annie Schreijer-Pierik, påpekade dock att i vissa länder med mycket djurhållning är 150 djur inte alls så stort.
Nästan alla AGRI-ledamöter hade dessutom problem med begreppet "industriell" i direktivets namn, som om dessa tre sektorer vore stora industrier. Kommissionens talesperson kunde bara påpeka att direktivets namn har funnits i många år och att det nu gäller för en något större del av djurhållningen. Dessutom vände kommissionen på steken genom att påminna Europaparlamentarikerna om att inget göra inte är en lösning.
Ett ofta använt argument mot hårdare miljökrav inom jordbruket är att den agrara sektorn redan har minskat föroreningarna på många områden. EVP-kristdemokraterna anser därför att det tillfälligt bör bli stopp för nya miljökrav. Men kommissionen påpekar att nitratföroreningen under decennier inte har minskat.
Huvudmålet med IED (att branschen inom några år ska vara skyldig att använda den mest tillgängliga moderna tekniken) möter också mycket kritik. Det kommer för en liten svinbonde på Cypern att vara något helt annat än för en stor svinuppfödare i Tyskland eller Spanien, konstaterades det.
Nederländske SGP-politikern Bert-Jan Ruissen föreslog för sina kollegor att miljöpolitiken inom jordbruket kanske måste tas från en helt annan vinkel: att EU inte längre föreskriver ett medel eller en teknik, utan ett mål. Och att bonden – inom lagens ramar – själv får hitta medlen för att nå det målet. "Det innebär dock att vi också måste inkludera djurvälfärd, miljö och klimat i beräkningarna av dessa mål", varnade han.