Den nuvarande situationen väcker enligt EU-forskarna frågan om de nuvarande normerna verkligen är lämpliga.
Varje år transporteras tiotals miljoner kor, grisar, får, getter, fjäderfä och hästar för avel, uppfödning eller slakt. Enligt revisorerna beror detta på att djurhandlare försöker utnyttja pris skillnaderna mellan EU:s medlemsländer för att göra vinst.
I en analys som publicerades i måndags belyser EU-revisorerna trender inom djurtransporter. De påpekar att djurhållningen inte är jämnt fördelad över EU-länderna och regionerna, och att djuruppfödare ofta är specialiserade på en enda art eller produktionsstadium. Dessutom finns det färre gårdar och slakterier, men de är större.
"EU-lagstiftningen om djurtransporter tillämpas inte på samma sätt i medlemsländerna och det finns en risk att transportörer utnyttjar kryphål som följer av de olika nationella sanktionssystemen", säger Eva Lindström, ledamot av revisionsrätten som ledde undersökningen.
Det finns en risk att transportörer väljer längre rutter för att slippa köra genom länder med striktare efterlevnad av EU-reglerna. Revisorerna betonar att de negativa konsekvenserna kan begränsas genom att minska antalet transporter och deras längd.
De pekar också på alternativ till levande djurtransporter. I vissa fall skulle slakten kunna ske närmare produktionsplatsen: genom att använda lokala och mobila slakterier skulle djurtransporter delvis kunna elimineras och samtidigt bli mer miljövänliga.
Konsumenterna spelar också en viktig roll i att driva förändring. En undersökning visar att vissa är villiga att betala mer för kött, men bara om de vet att djuren har haft ett gott liv. Enligt revisorerna skulle konsumenter göra mer medvetna köp om de hade bättre information. Detta skulle kunna uppnås genom införandet av ett EU-omfattande märkningssystem för djurvälfärd.