Urvalet av de nya kommissionärerna blir en komplicerad process där Von der Leyen måste försöka nå en överenskommelse om fördelningen av kommissionärsposterna. Denna överenskommelse ska inte bara gälla personerna själva, utan också fördelningen av specifika portföljer och en balanserad representation av olika politiska partier.
Även om Von der Leyen har det slutgiltiga ansvaret, har premiärministrarna i EU-länderna en stor informell påverkan på fördelningen av portföljer i förväg. Slutligen måste Europaparlamentet godkänna de föreslagna kommissionärerna och uppgiftsfördelningen.
En av de största utmaningarna för Von der Leyen är hennes strävan efter en könsbalanserad kommission. År 2019 lyckades hon för första gången skapa en jämställd man-kvinna-fördelning i kommissionen, men det verkar nu vara mycket svårare. Trots att hon uppmanat medlemsländerna att nominera både en manlig och en kvinnlig kandidat, har de flesta länder bara lämnat in en manlig kandidat. Detta hotar att rubba könsbalansen.

