Áo là quốc gia duy nhất trong EU cho đến nay phản đối hiệp định này do những ảnh hưởng tiêu cực đến ngành nông nghiệp và công nghiệp chế biến thịt của Áo. Sự phản đối này đã được đưa ra cách đây bốn năm. Mặc dù nhiều quốc gia EU khác cũng chia sẻ các mối quan ngại về nông nghiệp của Áo, nhưng họ không chuyển thành sự bác bỏ chính thức.
Hiệp định với các nước Mercosur gồm Brazil, Argentina, Uruguay và Paraguay dự kiến sẽ được ký kết trong nửa cuối năm nay dưới sự chủ trì của Tây Ban Nha tại Hội đồng EU. Giống như năm 2019, hiệp định thương mại có thể thất bại nếu Viên dùng quyền phủ quyết cuối cùng. Quyết định cuối cùng của Áo nằm trong tay Bộ trưởng Kinh tế Martin Kocher, chứ không phải Bộ trưởng Nông nghiệp Norbert Totschnig.
Các nước lớn trong EU như Đức và Pháp nhấn mạnh rằng việc đình chỉ hoặc hủy bỏ Mercosur là không thực tế. Bởi vì hiệp định này đã được thương lượng tỉ mỉ từ nhiều năm trước, đặc biệt trong lĩnh vực nhập khẩu và xuất khẩu.
Nhiều quốc gia EU như Tây Ban Nha muốn có một “bổ sung” cho hiệp định Mercosur liên quan đến các phương pháp canh tác thân thiện với môi trường và bảo vệ các khu vực rừng nguyên sinh. Trong trường hợp đó, hiệp định có thể được phê chuẩn vào cuối năm nay “với một tờ bổ sung”, với điều kiện Áo “nhượng bộ”.
Greenpeace và Đảng Xanh Đức đã lên tiếng phản đối hiệp định vì những tác động xấu đến môi trường và khí hậu. Họ cho rằng việc nhập khẩu thịt giá rẻ từ Nam Mỹ sẽ dẫn đến phá rừng quy mô lớn và tăng phát thải khí nhà kính. Tuy nhiên, Bộ trưởng Nông nghiệp Đức Cem Özdemir (Đảng Xanh) và Ủy ban Châu Âu trong thời gian gần đây đã nhiều lần nhấn mạnh rằng hiệp định thương mại này có thể góp phần vào việc phát triển nông nghiệp bền vững và bảo tồn rừng, đặc biệt tại Nam Mỹ.