Sáu tổ chức khoa học châu Âu đã kêu gọi trong một bức thư gửi Nghị viện châu Âu về việc cần thiết phải xem xét lại sâu rộng chính sách nông nghiệp của EU. Theo hơn 2500 nhà khoa học, nông nghiệp hiện đại với cường độ cao đang phá hủy thiên nhiên và do đó chính sách nông nghiệp châu Âu cần được cải tổ triệt để càng sớm càng tốt. BirdLife Nederland là một trong những tổ chức đã công bố lời kêu gọi này trên tạp chí Nature.
Các tác giả cho rằng chính sách nông nghiệp EU hiện tại gây thiệt hại lớn cho đa dạng sinh học tự nhiên, đặc biệt là tại các vùng nông thôn. Chính sách châu Âu quá tập trung vào việc mở rộng quy mô để tối đa hóa sản lượng. Điều này thường dẫn đến những thay đổi không thể hồi phục tại các khu vực, khiến chúng ngày càng trở nên không phù hợp làm môi trường sống cho các loài chim, côn trùng hoặc động vật có vú.
Các nhà khoa học chỉ ra các con số: tại EU, số lượng chim vùng nông thôn đã giảm hơn 55% từ năm 1980 đến năm 2015, ở các khu bảo tồn thiên nhiên của Đức, số lượng côn trùng giảm hơn ba phần tư. Số lượng các loài động vật khác cũng như thực vật và thảo mộc trên đất nông nghiệp thể hiện xu hướng suy giảm tương tự. Việc mở rộng quy mô khiến không còn đủ không gian cho các bờ ruộng nhiều hoa hay các mép mương. Ngoài ra, mực nước ngầm tại nhiều nơi đã bị hạ thấp để phục vụ lợi ích của nông dân.
Quỹ trợ cấp nông nghiệp của châu Âu khoảng 60 tỷ euro. Trung bình mỗi cư dân EU mỗi năm đóng góp 114 euro cho chính sách nông nghiệp chung. Số tiền này đã trở thành đề tài trong một chiến dịch quảng bá quanh cuộc bầu cử châu Âu mùa xuân năm nay. Các tờ tiền 114 euro được phát hành nhằm kêu gọi chính sách nông nghiệp châu Âu xanh hơn.
Ngoài ra, chính sách nông nghiệp EU còn bị chỉ trích do có thể liên quan đến gian lận và lạm dụng các khoản trợ cấp nông nghiệp. Sau nhiều tháng điều tra ở chín quốc gia thành viên, tờ The New York Times đã công bố một bài viết mô tả cách các chính trị gia ở các nước như Hungary và Cộng hòa Séc đã lợi dụng một phần quỹ nông nghiệp cho lợi ích cá nhân hoặc của các chủ đất lớn thân hữu. Bài báo lấy ví dụ Thủ tướng Cộng hòa Séc được cho là đã nhận hàng chục triệu euro trợ cấp trong năm vừa qua.
The New York Times gọi hệ thống trợ cấp này là một hệ thống cố ý thiếu minh bạch và theo cách đó đã làm suy yếu các mục tiêu môi trường của EU. Brussels được cho là đã để mặc sự tham nhũng này vì nếu xử lý sẽ đồng nghĩa việc phải xem xét lại toàn bộ chính sách nông nghiệp, trong khi các khoản trợ cấp lớn này là nguồn thu quan trọng đối với nhiều quốc gia EU.