Quá trình lựa chọn các Ủy viên mới sẽ là một quy trình phức tạp, trong đó Von der Leyen phải cố gắng đạt được sự đồng thuận về phân bổ các ủy ban. Sự đồng thuận này không chỉ bao gồm các cá nhân mà còn về phân công các lĩnh vực công tác cụ thể và sự đại diện cân bằng của các đảng phái chính trị khác nhau.
Mặc dù Von der Leyen chịu trách nhiệm cuối cùng, các thủ tướng của các quốc gia EU từ trước đã có ảnh hưởng lớn một cách không chính thức lên việc phân bổ lĩnh vực công tác. Cuối cùng, Nghị viện châu Âu phải đồng ý với các Ủy viên được đề cử và việc phân chia nhiệm vụ.
Một trong những khó khăn lớn nhất đối với Von der Leyen là nỗ lực tạo nên một Ủy ban có cân bằng giới tính. Năm 2019, bà đã thành công lần đầu tiên tạo ra sự cân bằng giữa nam và nữ trong Ủy ban, nhưng giờ đây điều đó có vẻ khó khăn hơn nhiều. Dù bà đã yêu cầu các quốc gia thành viên đề xuất cả ứng cử viên nam và nữ, phần lớn các nước chỉ gửi một ứng viên nam. Điều này đe dọa làm lệch cán cân giới tính.

