Ủy ban châu Âu khăng khăng rằng cần phải làm điều gì đó để chống lại ô nhiễm không khí và đất do chăn nuôi, ngành công nghiệp gia cầm và chăn nuôi lợn gây ra. Một phát ngôn viên của Ủy ban cho biết những phản đối của Ủy ban Nông nghiệp về việc mở rộng Chỉ thị Phát thải Công nghiệp (RIE) bị phóng đại quá mức.
Brussels muốn bao gồm cả chăn nuôi từ 150 con gia súc trở lên, đồng thời thắt chặt các tiêu chuẩn đối với các trang trại nuôi lợn và gia cầm để nhiều doanh nghiệp hơn nằm trong phạm vi áp dụng. Tuy nhiên, Ủy ban châu Âu sẵn sàng thỏa hiệp về một số điểm. Ủy ban phủ nhận việc có một quy định áp đặt nào; mọi người đều đã có cơ hội tham gia thảo luận.
Ủy ban ENVI-Môi trường của Nghị viện châu Âu đồng ý rằng trong các lĩnh vực này cũng cần thực hiện nguyên tắc “người gây ô nhiễm phải trả tiền”. Ủy ban nông nghiệp AGRI phản đối các đề xuất hiện tại (giống như nhiều chính phủ EU) nhưng phe Đảng Xanh cho biết họ sẽ đưa ra các văn bản thỏa hiệp trong cuộc đàm phán ba bên sắp tới.
Trong một phiên điều trần kết hợp, một phát ngôn viên của Ủy ban châu Âu nhấn mạnh rằng đối với chăn nuôi, chỉ những trang trại rất lớn mới bị ảnh hưởng; tối đa khoảng 15%. Tuy nhiên, một số nghị sĩ châu Âu, như nghị sĩ Hà Lan thuộc đảng CDA Annie Schreijer-Pierik, chỉ ra rằng ở một số quốc gia có nhiều chăn nuôi thì 150 con gia súc không phải là một con số quá lớn.
Hầu hết các thành viên ủy ban AGRI cũng gặp khó khăn với thuật ngữ “công nghiệp” trong tên của Chỉ thị, như thể ba ngành này là các ngành công nghiệp lớn. Phát ngôn viên của Ủy ban chỉ có thể cho biết tên gọi của chỉ thị RIE đã tồn tại nhiều năm và hiện đang áp dụng cho một phần lớn hơn trong lĩnh vực chăn nuôi. Hơn nữa, Ủy ban cũng phản bác bằng cách nhắc nhở các nghị sĩ rằng không làm gì cũng không phải là giải pháp.
Một luận điểm thường được nghe phản đối các yêu cầu nghiêm ngặt hơn về môi trường trong nông nghiệp là ngành nông nghiệp đã giảm ô nhiễm rất nhiều trên nhiều lĩnh vực. Các chính khách thuộc chính đảng Dân chủ Kitô giáo EVP thậm chí cho rằng nên tạm dừng các yêu cầu môi trường mới. Nhưng Ủy ban nhấn mạnh ô nhiễm nitrat đã không được kiểm soát trong nhiều thập kỷ.
Mục tiêu chính của RIE (trong vài năm tới buộc ngành phải sử dụng các kỹ thuật hiện đại nhất có sẵn) cũng gặp nhiều chỉ trích. Người ta lưu ý rằng điều này sẽ rất khác nhau đối với một trang trại lợn nhỏ ở Cyprus so với một trang trại lớn ở Đức hoặc Tây Ban Nha.
Người Hà Lan thuộc SGP, ông Bert-Jan Ruissen, đề nghị các đồng nghiệp rằng chính sách môi trường trong nông nghiệp có thể cần được thay đổi hoàn toàn: EU không nên chỉ định một phương tiện, một kỹ thuật, mà nên xác định một mục tiêu. Và người nông dân sẽ tự tìm phương tiện hợp pháp để đạt được mục tiêu đó. “Điều này cũng có nghĩa là chúng ta phải tính đến phúc lợi động vật, môi trường và khí hậu trong các phép tính về những mục tiêu đó”, ông cảnh báo.