Основните източници на замърсяване са торове и химически вещества от селското стопанство, които замърсяват водата с хранителни вещества като азот и фосфор, водещи до евтрофикация. Освен това индустриалните отпадъчни води допринасят за химическото замърсяване на реки, езера и крайбрежни води.
Също така структурните промени в водните пътища, като язовири и канализация, са допринесли за екологичния упадък, показва нов доклад на Европейската агенция за околна среда.
Повърхностните води се считат за от ключово значение за поддържането на биологичното разнообразие, но в много региони в Северозападна Европа (включително Белгия, Нидерландия и Германия) качеството на повече от 90% от водните тела е определено като средно, лошо или много лошо.
Планираната ревизия на директивите на ЕС относно замърсяването на почвите и справянето с измиването на химически вещества е от решаващо значение. Тази ревизия на рамковата директива трябва не само да подобри качеството на водата, но и да възстанови здравето на екосистемите.
Освен заплашващото замърсяване на повърхностните води, Европа вече трябва да се справя и с климатичните промени, които допълнително натоварват водната сигурност. Повишаващите се температури, променящите се модели на валежите и периодите на растителна суша увеличават водния стрес в различни региони, особено в Южна Европа. Водни тела като реки и езера там се замърсяват по-бързо, което допълнително уврежда качеството на водата.