Η αντίσταση προέρχεται κυρίως από περιβαλλοντικές οργανώσεις και κριτικούς πολίτες που φοβούνται ότι ο πολιτικός της CSU θα ακολουθήσει πολιτική γεωργίας επιβλαβή για το κλίμα και τη βιοποικιλότητα.
Ο Φελσνέρ κατέχει επί του παρόντος τη θέση του προέδρου της Βαυαρικής Ένωσης Αγροτών και είναι επίσης αντιπρόεδρος της ομοσπονδιακής γερμανικής Ένωσης Αγροτών. Οι στενές του σχέσεις με τον αγροτικό τομέα και οι χαρακτηριστικές του απόψεις τον καθιστούν, για κάποιους, μια αμφιλεγόμενη υποψηφιότητα για τη θέση του υπουργού. Απολαμβάνει την υποστήριξη του συντηρητικού πρωθυπουργού της Βαυαρίας, Μάρκους Ζέντερ (CSU), που αξιοποιεί την επιρροή του προκειμένου να εισαγάγει τον Φελσνέρ στην κυβέρνηση του ηγέτη της CDU, Φρίντριχ Μερτς.
Οι περιβαλλοντικές οργανώσεις αναφέρουν ότι ο Φελσνέρ αγνοεί τα επιστημονικά δεδομένα σχετικά με τις αρνητικές επιπτώσεις των φυτοφαρμάκων και τις κλιματικές συνέπειες της κατανάλωσης κρέατος. Σε συνέδριο του κόμματος CSU στις αρχές Φεβρουαρίου αμφισβήτησε επιστημονικά γεγονότα για την προστασία των ειδών και του κλίματος, χαρακτηρίζοντας τη μείωση του ποσού του ζωικού κεφαλαίου ως αδιέξοδη πορεία.
Το 2023, κατά τη διάρκεια διαδήλωσης αγροτών, προέτρεψε να καταναλώνεται «κρέας για το κλίμα». Επίσης, απείλησε, ως ένας από τους ηγέτες των αγροτικών διαδηλώσεων, να παραλύσει τη χώρα. Το 2018 καταδικάστηκε για ρύπανση εδαφών και υδάτων, επειδή για μεγάλο χρονικό διάστημα απέλυε νερά και υγρά από την περιουσία του σε γειτονική φυσική περιοχή. Τέτοιες δηλώσεις και περιστατικά έχουν πλήξει τη φήμη του ως διαχειριστή γεωργίας.
Παρά αυτά, ο Φελσνέρ παραμένει δημοφιλής στις αγροτικές οργανώσεις, που βλέπουν τον διορισμό του ως ευκαιρία να ευθυγραμμιστεί περισσότερο η γερμανική αγροτική πολιτική με τα συμφέροντα του αγροτικού τομέα. Πολλοί αγρότες τον θεωρούν υπερασπιστή των παραδοσιακών μεθόδων γεωργίας και αντίπαλο των αυστηρών περιβαλλοντικών κανονισμών, τους οποίους θεωρούν απειλή για την επιχείρησή τους.
Εκτός από την αίτηση του Umweltinstitut München, αρκετές πρωτοβουλίες πολιτών και πράσινα πολιτικά κόμματα έχουν εκφράσει τις ανησυχίες τους για τον πιθανό διορισμό. Συνεχίζονται οι προετοιμασίες για διαδηλώσεις και κινητοποιήσεις με στόχο την άσκηση πίεσης στον ηγέτη της CDU Φρίντριχ Μερτς, ο οποίος θα αποφασίσει τελικά ποιος θα αναλάβει τη θέση του υπουργού. Η αντίσταση στον Φελσνέρ αποτελεί μέρος ενός ευρύτερου πολιτικού αγώνα για το μέλλον της γερμανικής γεωργίας.
Ο Φρίντριχ Μερτς δεν έχει ακόμη τοποθετηθεί ρητά επί του θέματος. Εντός της CDU υπάρχει διχογνωμία για το αν ένας έντονος λόμπι αγροτικής πολιτικής όπως ο Φελσνέρ είναι κατάλληλος για τη θέση του υπουργού. Κάποια μέλη του κόμματος φοβούνται ότι ο διορισμός του μπορεί να βλάψει την εικόνα του κόμματος ως σύγχρονου και ευαισθητοποιημένου στο κλίμα, ενώ άλλοι τον βλέπουν ως ισχυρό εκπρόσωπο της αγροτικής βάσης.