Τα στοιχεία ταυτότητας δεκατριών μαρτύρων στην υπόθεση MH17 θα παραμείνουν απόρρητα. Σύμφωνα με τον ανακριτή δικαστή, αυτοί οι μάρτυρες έχουν δικαίωμα στην προστασία, επειδή μπορεί να αισθανθούν απειλή ή να βρεθούν σε κίνδυνο. Το Γενικό Εισαγγελικό Λειτουργείο τονίζει ότι υπάρχουν «σημαντικοί κίνδυνοι για τους μάρτυρες».
Δεν έχει ακόμη αποκαλυφθεί πολλά σχετικά με την κατάσταση αυτών των «ανώνυμων μαρτύρων». Για παράδειγμα, δεν είναι σαφές αν εξακολουθούν να ζουν ή να διαμένουν στην Ουκρανία ή στη Ρωσία, ή αν έχουν φιλοξενηθεί σε άλλη τοποθεσία με βοήθεια από την Ολλανδία. Οι καταθέσεις τους είναι ζωτικής σημασίας για το αποδεικτικό υλικό κατά των τεσσάρων κατηγορουμένων και πιθανώς και για άλλους μελλοντικούς κατηγορουμένους.
Επίσης, δεν είναι ξεκάθαρο αν απολαμβάνουν την ίδια προστασία ως «ανώνυμοι μάρτυρες» με αυτή που παρέχεται σε «μάρτυρες-«στέμματα» σε συνηθισμένες (μεγάλες) ποινικές υποθέσεις στην Ολλανδία. Σε κάποιες περιπτώσεις, αυτοί λαμβάνουν (εκτεταμένη) χρηματική αποζημίωση για απώλεια εισοδήματος ή υφιστάμενη ζημία, ή ακόμη και νέα ταυτότητα και προστασία.
Εντυπωσιακό είναι ότι οι περισσότεροι από τους προστατευόμενους μάρτυρες ακούστηκαν μόλις το 2019. Αυτό συνέβη από έναν ολλανδό ανακριτή δικαστή («δικαστής έρευνας»). Οι καταθέσεις τους καταγράφηκαν σε βίντεο, όπου οι μάρτυρες ήταν μη αναγνωρίσιμοι στο πλάνο. Στις εξετάσεις αυτές δεν παρευρέθηκαν οι τρεις ολλανδοί εισαγγελείς («οι κατηγορητές») ούτε οι συνήγοροι των κατηγορουμένων («η υπεράσπιση»).
Για έναν μάρτυρα, το αίτημα να διατηρηθεί η ταυτότητα μυστική απορρίφθηκε από το δικαστήριο. Ο ανακριτής δικαστής θεωρεί πως ο μάρτυρας μπορεί να αισθανθεί απειλή λόγω της κατάθεσής του, αλλά πρακτικά είναι αδύνατον να διασφαλιστεί η ανωνυμία του. Τι ακριβώς σημαίνει και περιλαμβάνει αυτό, δεν έχει γίνει ακόμα σαφές. Επίσης, δεν είναι γνωστό αν αυτός ο μάρτυρας θα πρέπει να εμφανιστεί στο δικαστήριο.
Οι τρεις εισαγγελείς ζήτησαν από το δικαστήριο να συντάξει «περίληψη» της βιντεοσκοπημένης εξέτασης του μάρτυρα M58. Πρόσφατα ο ίδιος αποκάλυψε την ταυτότητά του, αλλά στη διαδικασία εξακολουθεί να αντιμετωπίζεται ως ανώνυμος μάρτυρας. Σύμφωνα με τους κατηγόρους, ο ύποπτος ήταν ο ίδιος παρών κατά την εκτόξευση του πυραύλου BUK και έχει δει και μιλήσει με αρκετούς Ρώσους αξιωματούχους.
Επίσης, οι εισαγγελείς επιθυμούν να εξετάσουν πέντε άλλους ανώνυμους μάρτυρες λεπτομερώς. Αυτό μπορεί εάν χρειαστεί να γίνει ξανά ανώνυμα από ανακριτή δικαστή, υπό την προϋπόθεση ότι οι εισαγγελείς και οι δικηγόροι μπορούν να υποβάλουν εγγράφως ερωτήσεις εκ των προτέρων. Με αυτόν τον τρόπο μπορεί να επιτευχθεί η δημοσιοποίηση μεγαλύτερου μέρους του υποκείμενου αποδεικτικού υλικού. Επίσης, μπορεί να αναιρεθεί εν μέρει ο ισχυρισμός ότι μεγάλο μέρος των αποδεικτικών στοιχείων είναι ανώνυμο και επομένως «ύποπτο».
Οι επτά δικηγόροι των συγγενών των θυμάτων έχουν επίσης υποστηρίξει στο δικαστήριο ότι πρέπει να δημοσιοποιηθεί μεγαλύτερο μέρος του αποδεικτικού υλικού. Με αυτόν τον τρόπο, τα πενθούντα μέλη οικογενειών θα έχουν καλύτερη κατανόηση για το τι ακριβώς συνέβη την μοιραία ημερομηνία 17 Ιουλίου 2014.
Το Γενικό Εισαγγελικό Λειτουργείο επιθυμεί επίσης το δικαστήριο της υπόθεσης MH17 στο Σχίπχολ να δει την ανακατασκευασμένη αναπαράσταση του κατεστραμμένου μαλαισιανού αεροσκάφους. Τα συντρίμμια του αεροπλάνου που κατερρίφθη στο ανατολικό τμήμα της Ουκρανίας μεταφέρθηκαν το 2015 στην Ολλανδία για τις ανάγκες της έρευνας JIT και τώρα είναι ανακατασκευασμένα ως ημι-ναυάγιο σε ένα υπόστεγο της αεροπορικής βάσης Γκιλζε-Ράιεν.
Οι τρεις εισαγγελείς υπέβαλαν την πρόταση για επιθεώρηση τη δεύτερη ημέρα της δίκης των τεσσάρων κατηγορουμένων. Σύμφωνα με τους εισαγγελείς, είναι σημαντικό για τους δικαστές να σχηματίσουν «πλήρη εικόνα της ζημιάς με τα ίδια τους τα μάτια». Το Γενικό Εισαγγελικό Λειτουργείο ζητά το δικαστήριο να αποφασίσει σύντομα αν η επιθεώρηση θα γίνει. Πιθανόν η επιθεώρηση να πραγματοποιηθεί τον Ιούνιο, όταν αρχίσει το δεύτερο μέρος της δίκης. Ένα τρίτο τμήμα συνεδριάσεων προβλέπεται αρχές Σεπτεμβρίου και μια τρίτη φάση τον Φεβρουάριο του επόμενου έτους.