Μετά την εκτενή έρευνα του ειδησεογραφικού ιστότοπου Politico για την απάτη στον ελληνικό αγροτικό τομέα, οι ελληνικές αρχές ανακοίνωσαν ότι θα διενεργήσουν δική τους έρευνα. Ο υπουργός Αγροτικής Ανάπτυξης Κώστας Τσιάρας δήλωσε ότι η Αθήνα «δεν μπορεί να θέσει σε κίνδυνο τη ροή των ευρωπαϊκών κονδυλίων» και ότι «η πλήρης διαφάνεια είναι απαραίτητη για να διασφαλιστεί ότι οι επιδοτήσεις πηγαίνουν σε όσους τις αξίζουν πραγματικά».
Αναφέρθηκε ότι πρόκειται για ένα καθεστώς επιδότησης όπου χιλιάδες αγρότες και αιτούντες λάμβαναν χρηματοδότηση με ψευδείς ισχυρισμούς, ωστόσο ο Ελληνικός Οργανισμός Πληρωμών και Ελέγχου Κοινοτικών Ενισχύσεων Προσανατολισμού και Εγγυήσεων (ΟΠΕΚΕΠΕ) ανέφερε πως υπάρχει έρευνα για μόλις 400.000 ευρώ, με πολλούς αιτούντες να επιστρέφουν χρήματα ή να μην έχουν λάβει ποτέ πληρωμές.
Ο υπουργός Τσιάρας διέταξε περισσότερους ελέγχους και εργάζεται πάνω σε νέο νομοσχέδιο για την καταγραφή των γεωργικών βοσκοτόπων. Ο ιστότοπος Politico ανέφερε ότι από το 2017 Έλληνες πολίτες λάμβαναν επιδοτήσεις για βοσκότοπους που δεν κατείχαν ή δεν μίσθωναν, ή για αγροτικές δραστηριότητες που δεν πραγματοποιήθηκαν ποτέ.
Η Ελλάδα αριθμεί περισσότερα από 6.000 νησιά, από τα οποία περίπου 250 είναι κατοικημένα. Μόνο περίπου 80 νησιά έχουν πάνω από 100 κατοίκους. Λόγω αυτής της γεωγραφικής δομής, η χώρα σχεδόν δεν διαθέτει καλά λειτουργώντας κτηματολόγιο και η κεντρική κυβέρνηση στην Αθήνα έχει περιορισμένη εποπτεία και έλεγχο στις τοπικές (αγροτικές) δραστηριότητες. Αυτό ισχύει επίσης για τη συλλογή πολλών φόρων. Το ίδιο συνέβαινε και το 2010 όταν ήρθε στο φως η ελληνική κρίση χρέους, κατά τη διάρκεια της οποίας η Αθήνα παρείχε για χρόνια στην Ευρωπαϊκή Επιτροπή λανθασμένα ή παραποιημένα στοιχεία.
Οι αρχές αναφέρουν τώρα ότι έχουν εντοπίσει πάνω από 16.000 φορολογικούς ΑΦΜ που σχετίζονται με ακανόνιστες αξιώσεις και έχουν επαληθεύσει 7.786 προς επανεξέταση, με 1.497 υπό δικαστική επίβλεψη, ενώ η οικονομική αστυνομία εξετάζει ακόμη 2.767 περιπτώσεις. Σε μια έκθεση της ΕΕ αναφέρεται ότι η έρευνα του Ευρωπαϊκού Γραφείου Δημόσιας Κατηγορίας (EPPO) δεν επικεντρώνεται μόνο στους απάτες ωφελούμενους, αλλά και στην πιθανή εμπλοκή αρχών του ελληνικού οργανισμού που διαχειρίζεται τις αγροτικές επιδοτήσεις.
Οι περισσότερες ύποπτες αιτήσεις προέρχονταν από την Κρήτη, η οποία το 2020 έλαβε τα δύο τρίτα των συνολικών αγροτικών επιδοτήσεων στην Ελλάδα. Σε ορισμένες περιπτώσεις, οι δικαιούχοι λάμβαναν ακόμη και επιδοτήσεις για γη εκτός Ελλάδας. Το EPPO ερευνά την υπόθεση από το 2021 και έχει ήδη προωθήσει εβδομήντα υποθέσεις στα ελληνικά δικαστήρια.