El núcleo del reglamento propuesto por la Comisión Europea es la clasificación de las técnicas NGT en dos categorías. Las plantas y alimentos naturales cuya modificación genética también podría surgir por mutación natural ya no se clasifican como alimentos modificados genéticamente. Sin embargo, todas las demás plantas NGT aún deben regirse por las normas aplicables a organismos genéticamente modificados.
Pero la posición alcanzada ahora por los países de la UE no resuelve algunos puntos sensibles, como la inclusión de una “obligación de notificación” en las etiquetas cuando un alimento ha sido modificado mediante tecnología OGM. Los países de la UE evitan tomar esta decisión al permitir una exclusión voluntaria, cediendo así a cada país la autorización de ciertas nuevas técnicas.
El compromiso del Consejo permite a los países de la UE prohibir el cultivo de plantas NGT de la segunda categoría en su territorio. También pueden tomar medidas para evitar la propagación de estas plantas, tanto dentro de sus fronteras como más allá de ellas. Alemania no está de acuerdo con esta regla excepcional.