핵심 است که توسط کمیسیون اروپا پیشنهاد شده، تقسیم تکنولوژی‌های NGT به دو دسته است. گیاهان و مواد غذایی طبیعی که تغییر ژنتیکی آنها می‌تواند به طور طبیعی توسط جهش‌های طبیعی رخ دهد، دیگر به عنوان غذای دستکاری ژنتیکی شده طبقه‌بندی نمی‌شوند. اما همه گیاهان NGT دیگر همچنان باید تحت قوانین مربوط به موجودات دستکاری ژنتیکی شده قرار بگیرند.
اما موضع فعلی کشورهای اتحادیه اروپا هنوز انتخابی برای حل چند نکته حساس نکرده است، مانند الزام به «اعلام» در برچسب‌ها اگر غذا با تکنولوژی GMO پردازش شده باشد. کشورهای اتحادیه اروپا این انتخاب را با ایجاد امکان لغو تعهد («opt-out») نادیده می‌گیرند، که اجازه می‌دهد پذیرش برخی از تکنیک‌های جدید به عهده خود کشورها گذاشته شود.
سازش شورای اتحادیه اروپا به کشورهای عضو اجازه می‌دهد کشت گیاهان NGT از دسته دوم را در قلمرو خود ممنوع کنند. آنها همچنین می‌توانند اقداماتی برای جلوگیری از انتشار این گیاهان، هم در داخل مرزهای خود و هم فراتر از آن، انجام دهند. آلمان با چنین قاعده استثنایی موافق نیست.