Euroopan komissio väittää, että Malta toimii Euroopan oikeuden vastaisesti järjestelmällään, jossa varakkaat ulkomaalaiset voivat maksua vastaan saada maltalaisen passin. Komissio katsoo, ettei EU-kansalaisuutta saa myydä, eikä EU-maiden saa käyttää kansallisia valtuuksiaan heikentääkseen unionin oikeuksia.
Malta puolestaan pitää kansalaisuuden myöntämistä yksinomaan kansallisena valtuutena, joka kuuluu sille ja pysyy sen käytössä. Maan mukaan politiikka on täysin laillista, ja ehdokkaiden seulontaan on suhtauduttu huolellisesti. Pääministeri Robert Abela on toistuvasti korostanut, että Malta päättää itse, kenestä tulee sen kansalainen.
Asia tuli julkisuuteen jo vuonna 2017, kun maltalainen toimittaja Daphne Caruana Galizia julkaisi juttuja maltalaisten poliitikkojen ja varakkaiden liikemiesten yhteyksistä kansainväliseen alamaailmaan. Hänet murhattiin pommi-iskulla rikkaiden rikollisten toimeksiannosta, mutta tekijät saatiin kiinni.
"Kultaiset passit" -asia sai lisää painoarvoa sen jälkeen, kun paljastui, että jotkut varakkaat venäläiset, joilla on maltalaiset passit, ovat EU:n pakotteiden kohteena osallisuudestaan Ukrainan sotaan. Financial Times raportoi, että pakotetut venäläiset ovat hankkineet EU-kansalaisuuden Maltan ohjelman kautta, mikä on lisännyt huolta turvallisuusriskistä.
Transparency Internationalin mukaan investointiohjelmien kautta tapahtuva passien myynti heikentää Euroopan unionin perusarvoja. Järjestö vaatii tiukempaa sääntelyä ja valvontamekanismeja estämään käytäntöjen väärinkäytön rahanpesuun tai pakotteiden kiertämiseen.
Euroopan komissio on myös aiemmissa vaiheissa virallisesti varoittanut Maltaa. Komissio totesi, että järjestely ei uhkaa ainoastaan kansallisia vaan myös eurooppalaisia etuja, sillä EU-kansalaisuus antaa oikeuksia kaikissa jäsenvaltioissa. Malta on kuitenkin tähän asti pitänyt kiinni ohjelmastaan, joskin tehnyt siihen joitain muutoksia.
Vuonna 2014 käyttöön otettu ohjelma on tuonut Maltalle huomattavia tuloja. Outbound Investmentin mukaan passien myynti on tuottanut satoja miljoonia euroja. Vastustajat huomauttavat kuitenkin, että taloudelliset voitot eivät korvaa EU:n maineelle mahdollisesti aiheutuvaa vahinkoa.
Euroopan unionin tuomioistuimen päätöksellä on arveltu olevan suuria vaikutuksia Maltalle ja mahdollisesti myös muille maille, joilla on vastaavia ohjelmia, kuten Kypros. Oikeudenkäyntiä pidetään testinä kansallisen suvereniteetin rajoille Euroopan integraatioprosessissa.