Vastustus tulee erityisesti ympäristöjärjestöiltä ja kriittisiltä kansalaisilta, jotka pelkäävät, että CSU-poliitikko johtaa maatalouspolitiikkaa, joka vahingoittaa ilmastoa ja biologista monimuotoisuutta.
Felßner toimii tällä hetkellä Baijerin maanviljelijäliiton puheenjohtajana ja on myös Saksan liittovaltion maanviljelijäliiton varapuheenjohtaja. Hänen läheiset siteensä maataloussektoriin ja selkeät mielipiteensä tekevät hänestä joillekin kiistanalaisen ehdokkaan ministerin virkaan. Hän nauttii konservatiivisen Baijerin ministeri-presidentin Markus Söderin (CSU) tukea, joka käyttää vaikutusvaltaansa saadakseen Felßnerin CDU-puolueen johtajan Friedrich Merzin hallitukseen.
Ympäristöjärjestöt sanovat, että Felßner sivuuttaa tieteelliset havainnot torjunta-aineiden kielteisistä vaikutuksista sekä lihan kulutuksen ilmastovaikutuksista. Helmikuun alussa CSU:n puoluekokouksessa hän kyseenalaisti tieteelliset tosiasiat lajien- ja ilmastonsuojelusta ja kutsui karjankasvun vähentämistä umpikujaksi.
Vuonna 2023 Felßner kehotti maanviljelijöiden mielenosoituksessa syömään "lihaa ilmaston puolesta". Hän uhkasi myös yhtenä maanviljelijäprotestien johtajista pysäyttää koko maan. Vuonna 2018 hänet tuomittiin maaperän ja veden saastuttamisesta, koska hän pitkään päästi taisteluita ja nesteitä tilastaan viereiseen luonnonsuojelualueeseen. Tällaiset lausunnot ja tapaukset ovat vahingoittaneet hänen mainettaan maatalousjohtajana.
Silti Felßner on suosittu maanviljelijäjärjestöjen keskuudessa, jotka näkevät hänen nimityksensä mahdollisuutena saada Saksan maatalouspolitiikka vastaamaan paremmin maatalousalan etuja. Monet maanviljelijät pitävät häntä perinteisten viljelymenetelmien puolustajana ja tiukkojen ympäristösääntöjen vastustajana, joita he pitävät uhkana yritystoiminnalleen.
Münchenin ympäristölaitoksen vetoomuksen lisäksi useat kansalaisaloitteet ja vihreät puolueet ovat ilmaisseet huolensa mahdollisesta nimityksestä. Mielenosoituksia ja protesteja valmistellaan painostamaan CDU-johtajaa Friedrich Merziä, joka päättää lopullisesti ministerin virasta. Vastustus Felßneria kohtaan on osa laajempaa poliittista taistelua Saksan maatalouden tulevaisuudesta.
Friedrich Merz ei ole vielä ottanut asiaan selkeää kantaa. CDU:ssa on jakautuneita mielipiteitä siitä, onko avoimesti maatalouslobbarina tunnettu Felßner sopiva ministeriksi. Jotkut puolueen jäsenet pelkäävät, että hänen nimityksensä voi vahingoittaa puolueen kuvaa modernina ja ilmastotietoisena, kun taas toiset näkevät hänet voimakkaana maatalouden taustaryhmän edustajana.