Cette résistance provient principalement d'organisations environnementales et de citoyens critiques qui craignent que ce politicien de la CSU mette en œuvre une politique agricole nuisible au climat et à la biodiversité.
Felßner occupe actuellement le poste de président de la Confédération des agriculteurs bavarois et est également vice-président de la Confédération fédérale des agriculteurs allemands. Ses liens étroits avec le secteur agricole et ses positions affirmées en font pour certains un candidat controversé pour le ministère. Il bénéficie du soutien du ministre-président bavarois conservateur Markus Söder (CSU), qui utilise son influence pour faire entrer Felßner dans le gouvernement du dirigeant de la CDU, Friedrich Merz.
Les organisations environnementales affirment que Felßner ignore les conclusions scientifiques concernant les effets négatifs des pesticides et les conséquences climatiques de la consommation de viande. Lors d'un congrès du parti CSU début février, il a remis en question les faits scientifiques relatifs à la protection des espèces et au climat et a qualifié la réduction du cheptel d'impasse.
En 2023, lors d'une manifestation d'agriculteurs, Felßner a appelé à « manger de la viande pour le climat ». Il a également menacé, en tant que l'un des leaders des protestations des agriculteurs, de paralyser le pays. En 2018, il a été condamné pour pollution des sols et de l'eau après avoir laissé fuir pendant une longue période du fumier et des liquides de sa ferme vers une zone naturelle adjacente. De telles déclarations et incidents ont nui à sa réputation en tant que gestionnaire agricole.
Pourtant, Felßner reste populaire au sein des organisations agricoles, qui voient sa nomination comme une opportunité d'aligner davantage la politique agricole allemande aux intérêts du secteur agricole. Beaucoup d'agriculteurs le considèrent comme un défenseur des méthodes agricoles traditionnelles et un opposant aux règles environnementales strictes qu'ils perçoivent comme menaçantes pour leur activité.
Outre la pétition de l'Institut pour l'Environnement de Munich, plusieurs initiatives citoyennes et partis politiques écologistes ont exprimé leurs inquiétudes quant à cette nomination possible. Des manifestations et actions de protestation sont en préparation pour exercer une pression sur Friedrich Merz, chef de la CDU, qui décidera en dernier ressort de l'attribution du poste ministériel. L'opposition à Felßner fait partie d'une lutte politique plus large sur l'avenir de l'agriculture allemande.
Friedrich Merz ne s'est pas encore exprimé explicitement sur le sujet. Au sein de la CDU, il existe un désaccord quant à savoir si un lobbyiste agricole aussi affirmé que Felßner est adapté au poste ministériel. Certains membres du parti craignent que sa nomination nuise à l'image du parti en tant qu'acteur moderne et conscient du climat, tandis que d'autres le voient justement comme un représentant puissant de la base agricole.