Après qu'un site d'information, Politico, eut mené une enquête approfondie sur la fraude dans le secteur agricole grec, les autorités grecques ont annoncé qu'elles lançaient leur propre enquête. Le ministre de l'Agriculture, Kostas Tsiaras, a déclaré qu'Athènes « ne pouvait pas compromettre le flux des fonds européens » et que « la transparence totale est essentielle pour garantir que les subventions parviennent à ceux qui les méritent véritablement ».
Il a été indiqué qu'il s'agissait d'un dispositif de subventions par lequel des milliers d'agriculteurs et demandeurs ont obtenu un financement sur de fausses bases, mais l'Agence de Contrôle grecque (OPEKEPE) a rapporté qu'une enquête de seulement 400 000 € était en cours, de nombreux demandeurs remboursant déjà l'argent ou n'ayant jamais reçu de paiements.
Le ministre Tsiaras a ordonné davantage d'audits et travaille sur un nouveau projet de loi pour cartographier les pâturages agricoles. Le site Politico a rapporté que des citoyens grecs recevaient depuis 2017 des subventions pour des prairies qu'ils ne possédaient ni ne louaient, ou pour des activités agricoles jamais réalisées.
La Grèce compte plus de 6000 îles, dont environ 250 sont habitées. Seules une huitantaine d’îles comptent plus de 100 habitants. En raison de cette configuration géographique, le pays dispose à peine d'un cadastre fonctionnel et le gouvernement central à Athènes a peu de surveillance et de contrôle sur les activités locales (agricoles). Cela vaut aussi pour la collecte de nombreuses taxes. Il en était de même en 2010, lors de la révélation de la crise de la dette grecque, où Athènes avait fourni pendant des années des données erronées ou falsifiées à Bruxelles.
Les autorités déclarent avoir trouvé plus de 16 000 numéros d'identification fiscale liés à des demandes irrégulières et en avoir vérifié 7 786 pour révision, avec 1 497 sous surveillance judiciaire et la police financière en train d’enquêter sur 2 767 autres. Un rapport de l’UE indique que l’enquête du Bureau européen du procureur (EPPO) ne se concentre pas uniquement sur les bénéficiaires frauduleux, mais également sur l’éventuelle implication des autorités de l’organisme grec qui distribue les subventions agricoles.
La plupart des demandes suspectes provenaient de Crète, qui en 2020 a reçu deux tiers du total des subventions agricoles grecques. Dans certains cas, des bénéficiaires recevaient même des aides pour des terrains situés hors de Grèce. L’EPPO enquête sur cette affaire depuis 2021 et a déjà porté soixante-dix dossiers devant les tribunaux grecs.