Srž prijedloga Europske komisije je podjela NGT-tehnika u dvije kategorije. Biljke i prirodna hrana čija genetska promjena može nastati prirodnom mutacijom više se ne smatraju genetski modificiranom hranom. Međutim, sve ostale NGT biljke i dalje moraju podlijegati pravilima o genetski modificiranim organizmima.
Trenutno postignuti stav zemalja EU još ne donosi odluku o rješavanju nekih ključnih pitanja, poput uvođenja obveze prijave na etiketama ako je hrana obrađena GMO tehnikom. Zemlje EU izbjegavaju tu odluku omogućavajući mogućnost izuzeća (opt-out), čime dopuštaju da pojedinačne zemlje same odlučuju o dopuštanju nekih novih tehnika.
Komprimis Vijeća dopušta državama članicama EU da zabrane uzgoj NGT biljaka druge kategorije na svojem teritoriju. One također mogu poduzimati mjere za sprječavanje širenja tih biljaka, kako unutar svojih granica tako i preko njih. Njemačka se ne slaže s takvim izuzetnim pravilom.

