Nafn þeirra þrettán vitna í MH17-málinu verður haldið leyndri. Samkvæmt rannsóknardómara eiga þessi vitni rétt á vernd vegna þess að þau gætu fundið fyrir ótta eða verið í hættu. Samkvæmt ríkissaksóknaraembættinu eru „talsverðar áhættur fyrir vitnin“.
Ekki hefur mikið verið gefið upp um stöðu þessara „nafnleyndu vitna“. Ekki er vitað hvort þau búi enn í Úkraínu eða Rússlandi eða hvort þau hafi verið flutt með hjálp Hollendinga annars staðar. Yfirlýsingar þeirra eru grundvallaratriði varðandi sönnunargögn gegn núverandi fjórum ákærðum, og mögulega einnig fyrir framtíðar nýja ákærða.
Einnig er óljóst hvort þau njóti sömu verndar sem „nafnlaus vitni“ eins og „krúnuvitni“ í venjulegum (stórum) hollenskum sakamálum. Slík vitni fá stundum (ríka) fjárhagslega bætur vegna tekjutaps eða tjóns eða jafnvel nýtt nafn og vakt.
Athygli vekur að flest vitnin sem njóta verndar voru fyrst kvöddu árið 2019. Það var gert af hollenskum rannsóknardómara („rannsóknardómari“). Framburður þeirra var tekinn upp á vídeó þar sem vitnin voru óviðurkennanleg. Þess viðtala sátu hvorki þrír hollenskir saksóknarar („ákærendur“) né verjendur ákærðu („varnarliðið“).
Ein beiðni um nafnleynd vitnis var hafnað af dómstólnum. Rannsóknardómari telur þrátt fyrir það að þetta vitni gæti fundið fyrir ótta vegna framburðar síns, en það er í raun ómögulegt að tryggja nafnleyndina. Hvað það nákvæmlega þýðir og felur í sér er ekki ljóst. Einnig er óvíst hvort þetta vitni muni verða að mæta fyrir dómi.
Þrír saksóknarar hafa beðið dómstólinn um að útbúa „yfirlit“ yfir vídeóyfirlestur vitnis M58. Hann hefur nýlega sjálfur afhjúpað auðkenni sitt en er enn vísað til sem nafnlaus vitni í málinu. Samkvæmt ákærendum var sá grunaði sjálfur viðstaddur þegar BUK-flugskeytinu var skotið á loft og hann sá og átti samskipti við nokkra rússneska embættismenn.
Ákærendur vilja einnig frekari yfirheyrslur á fimm öðrum nafnlausum vitnum. Það getur farið fram á ný, nafnlaust hjá rannsóknardómara ef ákærendur og verjendur ganga frá skriflegum fyrirspurningum fyrirfram. Með þessu geta þeir stuðlað að því að stærri hluti undirliggjandi sönnunargagna verði gerður opinber. Þetta getur einnig dregið úr þeirri gagnrýni að stór hluti sönnunargagna sé nafnlaus og því „grunsamleg“.
Jafnframt hafa sjö verjendur ættingja látinna haldið því fram fyrir dómi að stærri hluti sönnunargagna eigi að verða opinber, til að syrgjandi fjölskyldumeðlimir geti fengið betri skilning á því hvað gerðist nákvæmlega á þeim hörmulega degi 17. júlí 2014.
Ríkissaksóknari vill einnig að MH17-dómstóllinn á Schiphol skoði endurreist brotið af hins skotna malasíska flugvélinni. Flugskeytisbrotin af vélinni sem skotin var niður í austur-Úkraínu voru flutt til Holland árið 2015 fyrir JIT-rannsóknina og eru nú endurbyggð sem hálfglöt eru í vélageymslu flugherstöðvarinnar Gilze-Rijen.
Þrír saksóknararnir lögðu fram tillögu um „skoðun“ á öðrum þingdegi í málinu gegn fjórum ákærðu. Samkvæmt ákærendum er dómurum mikilvægt að fá eigin sjónrænt yfirlit yfir skaðann. Ríkissaksóknari vill að dómstóllinn taki fljótlega ákvörðun um hvort skoðun eigi sér stað. Hún gæti mögulega farið fram í júní þegar seinni hluti málsins hefst. Þriðji dómþingstíminn er fyrirhugaður í byrjun september og þriðja stigið í febrúar á næsta ári.