La resistenza proviene principalmente da organizzazioni ambientali e cittadini critici che temono che il politico della CSU attuerà politiche agricole dannose per il clima e la biodiversità.
Felßner ricopre attualmente la carica di presidente dell'Unione dei Contadini Bavaresi ed è inoltre vicepresidente dell'Unione Federale dei Contadini Tedeschi. I suoi stretti legami con il settore agricolo e le sue posizioni dichiaratamente nette lo rendono per alcuni un candidato controverso per il ruolo ministeriale. Godrebbe del sostegno del conservatore ministro presidente bavarese Markus Söder (CSU), che utilizza la sua influenza per far entrare Felßner nell'esecutivo del leader CDU Friedrich Merz.
Le organizzazioni ambientaliste affermano che Felßner ignora le conoscenze scientifiche sugli effetti negativi dei pesticidi e sulle conseguenze climatiche del consumo di carne. Durante un congresso del partito CSU all'inizio di febbraio ha messo in discussione i dati scientifici riguardanti la protezione delle specie e del clima, definendo la riduzione del bestiame una strada senza uscita.
Nel 2023 Felßner ha invitato durante una manifestazione di agricoltori a «mangiare carne per il clima». Inoltre, come uno dei leader delle proteste contadine, ha minacciato di paralizzare il paese. Nel 2018 è stato condannato per inquinamento del suolo e delle acque poiché per lungo tempo ha lasciato filtrare liquidi e liquami dalla sua proprietà in un'area naturale adiacente. Tali dichiarazioni e incidenti hanno danneggiato la sua reputazione come amministratore agricolo.
Tuttavia, Felßner rimane popolare all'interno delle organizzazioni agricole, che vedono la sua nomina come un'opportunità per rendere la politica agricola tedesca più vicina agli interessi del settore agricolo. Molti agricoltori lo considerano un difensore dei metodi agricoli tradizionali e un oppositore di regolamentazioni ambientali severe, che percepiscono come una minaccia per le loro attività.
Oltre alla petizione dell'Umweltinstitut München, varie iniziative di cittadini e partiti politici verdi hanno espresso preoccupazione per la possibile nomina. Sono in preparazione manifestazioni e proteste per esercitare pressione sul leader CDU Friedrich Merz, che deciderà infine chi otterrà la carica ministeriale. La resistenza a Felßner fa parte di una più ampia lotta politica sul futuro dell'agricoltura tedesca.
Friedrich Merz non si è ancora espresso esplicitamente sulla questione. All'interno della CDU esiste una divisione sulla questione se un deciso lobbista agricolo come Felßner sia adatto al ruolo di ministro. Alcuni membri del partito temono che la sua nomina possa danneggiare l’immagine del partito come moderno e attento al clima, mentre altri lo vedono come un forte rappresentante della base agricola.