Den irske landbrukssektoren står dermed overfor en ny stor utfordring etter at Dublin nylig kunngjorde at flåten av husdyr må reduseres betydelig i kampen mot nitrogenoksider og klimagasser. Et av de mulige tiltakene er 200 000 færre melkekyr. Dette tiltaket er også ment å redusere gjødselproduksjonen og dermed minske nitratforurensningen.
Den forventede reduksjonen i husdyrflokken vil få betydelig innvirkning på den irske melkeproduksjonen og driften til mange bønder. Den irske regjeringen har tilsynelatende til hensikt å flytte fokuset mot mer bærekraftige landbruksmetoder og overgangen til mindre familiegårder.
EU-kommisjonen har gjentatte ganger uttrykt bekymring over nitratsituasjonen de siste årene. Følgen av dette er nå at Irland mister unntaket og må følge de samme reglene som andre EU-land, slik det tidligere har skjedd med Tyskland og Nederland.
I følge det irske miljøbyrået Environmental Protection Agency (EPA) finnes det områder i Irland hvor nitratforurensningen er spesielt høy. EPA-rapporten identifiserer disse spesifikke områdene hvor bruken av gjødsel må begrenses kraftig. Et av tiltakene er å senke grensen fra 250 til 220 kg nitrogen per hektar i det meste av Irland.
Som respons på tapet av unntaksstatus har Irish Farmers’ Association (IFA) avvist EPA-rapporten som "tull». IFA mener at de foreslåtte begrensningene er urealistiske og unødvendige. Bondeorganisasjonen antyder at myndighetene i stedet bør investere i bedre landbrukspraksis og teknologier for å håndtere nitratforurensningen.
Noen bønder som ikke lenger kvalifiserer for unntaket vurderer å gå over til økologisk melkeproduksjon. Irlands landbruksminister Helen Hackett oppfordrer ikke-unntaksbønder til å vurdere dette alternativet. Økologisk landbruk kan være en mer bærekraftig tilnærming, med strengere regler for gjødsling og redusert bruk av kjemikalier.

