I mai diskuterer handelskomiteen i Europaparlamentet den nye avgiften, etter at EU-landene tidligere har lagt til rette for dette. Det er mulig at avgjørelsen blir tatt i juni under en fullstendig plenumsdebatt i Europaparlamentet.
Bondeorganisasjoner og noen EU-medlemsland frykter at en plutselig innføring av høye avgifter vil føre til økte kostnader for bøndene, lavere avlinger og stigende matvarepriser. Ifølge dem vil det være ufornuftig å legge ekstra press på landbrukssektoren i usikre tider uten å tilby alternativer.
Landbrukskomiteen i Europaparlamentet mener at konsekvensene av nye avgifter for europeiske bønder vil bli altfor store. Høyere produksjonspriser truer med å svekke deres konkurranseposisjon, samtidig som de allerede står under press fra miljøregler og økte kostnader. Komiteen mener det må undersøkes hvor avhengige EU-landene er av russisk kunstgjødsel før man innfører slike tiltak.
Den europeiske landbruksorganisasjonen Copa-Cogeca oppfordrer også til utsettelse. Denne organisasjonen av bønder og samvirker påpeker at EU må unngå at bønder blir økonomiske ofre for geopolitisk politikk. Hvis avgiftene likevel blir vedtatt, krever Copa-Cogeca kompensasjon til de berørte bøndene for å unngå produksjonsproblemer.
Siden starten av den russiske krigen mot Ukraina har EU innført mange sanksjoner mot russiske råvarer, olje og stål. For kunstgjødsel, som for enkelte mat- og landbruksvarer, gjelder imidlertid ikke disse sanksjonene ennå. Debatten om kunstgjødsel berører derfor bredere spørsmål om handelspolitikk og matsikkerhet.
EU produserer ikke nok kunstgjødsel selv til å dekke eget behov. Over førti prosent av den brukte kunstgjødselen i Europa kommer fra Russland og Hviterussland. Tilgangen fra andre land er begrenset eller dyrere. En plutselig kraftig økning i importavgifter vil derfor raskt merkes på det europeiske landbruksmatmarkedet.
Noen tilhengere mener EU bør bli mindre avhengig av upålitelige leverandører. Ved å etterstrebe strategisk autonomi kan Europa beskytte seg mot geopolitisk press. Ifølge kritikere settes derimot matsikkerheten unødvendig på spill med denne tilnærmingen.
Den nederlandske Europaparlamentarikeren Bert-Jan Ruissen (SGP) forventer at importavgiftene vil øke gradvis. Han mener det er «viktig at regningen ikke legges på bøndene». Han peker også på at dette er et ekstra argument for å støtte bruken av landbruksbasert gjødsel som Renure. Dette fremmer sirkularitet, er mer bærekraftig og også billigere for bøndene, sier Ruissen.
Europakommisjonen arbeider samtidig med et nytt handelsregime med Ukraina, som før krigen importerte mye kunstgjødsel fra Russland. Det fører til ekstra tidspress og kompleksitet i debatten. Også frihandelen med Ukraina blir dermed satt under press, i likhet med konkurranseposisjonen til bønder i Øst-Europeiske naboland.

