Jedro predloga, ki ga je predstavila Evropska komisija, je razdelitev NGT-tehnologij v dve kategoriji. Rastline in naravna hrana, pri katerih lahko do genetskih sprememb pride tudi z naravno mutacijo, ne bodo več klasificirane kot gensko spremenjena hrana. Vse druge NGT-rastline pa morajo še vedno spadati pod pravila o gensko spremenjenih organizmih.
Vendar pa danes doseženi položaj držav EU še ni odločil o nekaterih občutljivih vprašanjih, kot je uvedba 'obveznosti prijave' na označbah, če je hrana obdelana z GMO-tehnologijo. Države EU se izogibajo tej odločitvi z možnostjo izvzetja, pri čemer dovoljenje nekaterih novih tehnik prepuščajo državam samim.
Kompromise Sveta dopuščajo državam EU prepoved gojenja NGT-rastlin druge kategorije na njihovem ozemlju. Prav tako lahko uvedejo ukrepe za preprečevanje širjenja teh rastlin tako znotraj svojih meja kot čez meje. Nemčija s to izjemo ni strinjena.

