De främsta föroreningskällorna är gödningsmedel och kemikalier från jordbruket, som förorenar vattnet med näringsämnen som kväve och fosfor, vilket leder till övergödning. Industrins avloppsvatten bidrar dessutom till den kemiska föroreningen av floder, sjöar och kustvatten.
Strukturella förändringar i vattenvägar, som dammar och kanalisering, har också bidragit till den ekologiska försämringen, visar en ny rapport från EU:s miljöbyrå.
Ytvatten betraktas som avgörande för att upprätthålla biologisk mångfald, men i många regioner i Nordvästeuropa (inklusive Belgien, Nederländerna och Tyskland) beskrivs kvaliteten på mer än 90 % av vattenmassorna som måttlig, dålig eller mycket dålig.

